Святыня находится в центральной части города Саки. История строительства храма началась в 1894 году с постройки колокольни в стиле греко-римского зодчества. Новый храм к колокольне достроили в 1903 году. Церковь возвели в русско-византийском стиле и освятили в честь Святого Ильи.
В 1929 году церковь закрыли, а здание переоборудовали под клуб. В этот период были снесены купола, уничтожена лепка, демонтирован иконостас, а колокольня использовалась как навигационный знак в судовождении. Но в 1942 году церковь вновь открыли для прихожан.
Реконструкция здания началась в 1990 году. В храме восстановили купола, расписали стены и воссоздали иконостас. В часовне был установлен колокол «Благовест». На сегодняшний день Свято-Ильинская церковь полностью приобрела первоначальный вид.
